下一代大肠癌测序检测到1/6患者的生殖系倾向

梅奥诊所医生进行的一项前瞻性多站点研究发现,每6名结直肠癌患者中就有1名(15.5%)具有该疾病的生殖系倾向,其中一半以上的患者在国家指导方针下无法检测到。该研究纳入了361名诊断为结肠直肠癌的患者队列。该队列是更大规模的使用主动基因检测(INTERCEPT)询问癌症病因研究的一部分,该研究包括2984名新的或活跃的癌症诊断患者,这些患者在亚利桑那州、佛罗里达州或明尼苏达州的梅奥诊所癌症中心就诊。

亚利桑那州梅奥诊所的胃肠病学家Niloy Jewel Samadder医学博士表示:“正在采取措施,确保所有患者都能获得基因组测序,以更好地了解导致癌症发展的基因。”。“这有助于我们了解如何准确定位治疗并提高生存率。”

结直肠癌队列
在本研究考虑的361名患者中,39.3%患有直肠癌。在结肠癌患者组中,40.6%患有右侧结肠癌。178名患者有详细的家族癌症史信息,其中9%的患者有一级亲属的结直肠癌家族史。

结直肠癌分期包括:
5.3%第1阶段
19.9%第2阶段
36.6%第3阶段
38.2%第4阶段
诊断时的中位年龄为57岁,43.5%为女性。近三分之一的患者体重指数(BMI)大于30,35%的患者曾吸烟。

分析生殖系倾向
所有患者均使用Invitae Multi Cancer panel上的83个基因(截至2019年7月为84个基因)的下一代测序小组免费进行生殖系测序。在Invitae进行了全基因测序、缺失和重复分析以及变体解释。从病历或电子问卷中收集临床、人口统计学、家族史和病理信息。那些具有致病性生殖系变异(PGV)的人被邀请进行基因咨询和级联家族变异检测,所有血亲都不承担任何费用。

根据本研究中进行的通用测试检测到的PGV(阳性结果)也与国家综合癌症网络(NCCN)、国家遗传咨询师协会和美国医学遗传学学院指南中概述的适应症进行了比较。如果在本研究中检测到PGV,并且根据这些指南不会检测到,或者如果它是指南中建议测序之外的基因,则认为PGV是增量的。

PGV和相关治疗改进
在考虑的患者中,56名患者(15.5%)共检测到62个PGV。5名患者有一个以上的PGV。在检测到PGV的患者中,21人被认为是高外显率,21人是中等外显率和7人是低外显率。有7名携带者与隐性综合征相关。

最常见的PGV为CHEK2(1.9%)、MSH2(1.4%)和单等位基因MUTYH(1.4%)。直肠癌患者的PGV发生率高于结肠癌患者,PGV患者和无PGV患者的总生存率相似。在11名患者中确认了Lynch综合征的分子诊断,23名患者具有与同源重组缺陷(HRD)相关的生殖系倾向。

Samadder博士说:“这可能导致基于癌症独特遗传基础的新型靶向治疗。”。“这使我们能够个性化护理,针对高危患者进行癌症筛查,并有希望在下一代家庭中完全预防癌症。”

近15%的PGV患者没有结直肠癌家族史,50岁以下患者的PGV发生率为21.8%,50岁以上患者为12.2%。Logistic回归分析显示,诊断年龄越小,患PGV的可能性越高。

34名患者的PGV增加,使用国家指南建议的适应症无法检测到。这在整个研究队列中占9.4%,在检测到PGV的患者中占60.7%。对于近10%的PGV患者,根据这些发现对其治疗方案进行了修改。

这项研究证明了通用多基因小组测试在检测更多临床可操作的遗传倾向方面的优势。在结直肠癌患者中发现PGV对患者及其家属都有治疗意义。更广泛的检测不仅可行,而且可以为制定个体化治疗计划提供宝贵的见解。

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